浮游菌是指悬浮在空气中的活微生物粒子，通过专门的培养基，在适宜的生长条件下繁殖到可见的菌落数。
在检测洁净车间时，根据《保健食品良好生产规范 GB 17405-1998》、《食品工业建筑技术规范 GB 50687-2011》、《药品包装材料生产厂房洁净室（区）的测试方法YBB00412004-2015》、《无菌医疗器具生产管理规范YY0033-2000》、《医药工业洁净厂房设计标准GB 50457-2019》等标准规范要求，需对洁净车间浮游菌进行检测。
如医药工业洁净室（区）浮游菌检测时，一般采用计数浓度法。即，通过收集悬浮在空气中的生物性粒子于专门的培养基（选择能证实其能够支持微生物生长的培养基），经若干时间和适宜的生长条件让其繁殖到可见的菌落计数，以判定该洁净室的微生物浓度。
选择该种方法之后，在对浮游菌进行采样时，采样器一般又用到撞击法原理。其中，采样器根据工作原理又分为狭缝式采样器、离心式或针孔式采样器三类。狭缝式采样器由内部风机将气流吸入，通过采样器的狭缝式平板，将采集的空气喷射并撞击到缓慢旋转的平板培养基表面上，附着的活微生物粒子经培养后形成菌落。离心式采样器由于内部风机的高速旋转，气流从采样器前部吸入从后部流出，在离心力的作用下，空气中的活微生物的粒子有足够的时间撞击到专用的固形培养基条上，附着的活微生物粒子经培养后形成菌落。针孔式采样器是气流通过一个金属盖吸入，盖子上是密集的经过机械加工的特质小孔，通过风 机将收集的细小的空气流直接撞击到平板培养基表面上，附着的活微生物粒子经培养后形成菌落。
在具体采样时，根据洁净车间等级，最小采样量如下表。
关于浮游菌采样点的位置，则可以参照GB/T 16292-2010。一般来说，工作区测点位置离地0.8-1.5m，送风口测点位置离送风面30cm左右。
